(1)

V článku 8 ods. 2 smernice 2003/99/ES sa od príslušného orgánu daného členského štátu vyžaduje, aby v spolupráci s príslušnými orgánmi zodpovednými za riešenie závažných cezhraničných ohrození ľudského zdravia a ich dôsledkov podľa rozhodnutia Európskeho parlamentu a Rady č. 2119/98/ES (2) preskúmal ohniská chorôb pochádzajúcich z potravín. Uvedené rozhodnutie bolo zrušené rozhodnutím Európskeho parlamentu a Rady č. 1082/2013/EÚ (3), ktoré bolo neskôr zrušené a nahradené nariadením Európskeho parlamentu a Rady (EÚ) 2022/2371 (4). Tieto šetrenia majú poskytnúť údaje o epidemiologickom profile, potenciálne dotknutých potravinách, možných príčinách ohnísk, ako aj zahrnúť primerané epidemiologické a mikrobiologické štúdie.

(2)

Efektívnosť a medziodvetvová spolupráca medzi orgánmi verejného zdravia a bezpečnosti potravín pri takýchto šetreniach je nevyhnutná na obmedzenie vplyvu ohniska na verejné zdravie a na minimalizáciu hospodárskeho vplyvu spojeného so stiahnutiami nebezpečných alebo potenciálne nebezpečných potravín od spotrebiteľov a s ich stiahnutím z trhu. Na tento účel je potrebná rýchla a spoľahlivá identifikácia šarží a dávok alebo zásielok obsahujúcich kontaminované potraviny a príčiny vzniku ohniska choroby.

(3)

Sekvenovanie celého genómu (WGS) je modernou molekulárnou analytickou technikou pre mikrobiologické štúdie, ktorá výrazne uľahčuje rýchlu identifikáciu klastrov mikroorganizmov, čím podporuje epidemiologické šetrenia. Umožňuje stanoviť prepojenia medzi izolátmi patogénov prenášaných potravinami, ktoré boli získané z ľudí, potravín, zo zvierat, z krmív a zo súvisiaceho prostredia počas šetrenia ohniska choroby.

(4)

S cieľom podstatne uľahčiť šetrenie ohnísk chorôb pochádzajúcich z potravín a včasné zistenie zdrojov týchto ohnísk by sa od členských štátov malo vyžadovať, aby zbierali izoláty patogénov Salmonella enterica, Listeria monocytogenes, Escherichia coli, Campylobacter jejuni a Campylobacter coli získané zo vzoriek potravín, zvierat, krmív a zo súvisiaceho prostredia u prevádzkovateľov potravinárskych a krmivárskych podnikov a počas úradných kontrol, ak tieto izoláty súvisia s ohniskom choroby pochádzajúcej z potravín alebo existuje podozrenie, že s ním súvisia. Od členských štátov by sa tiež malo vyžadovať, aby vykonávali WGS na týchto izolátoch.

(5)

Členské štáty by mali zaslať výsledky WGS vykonaného na izolátoch uvedených patogénov z potravín, zo zvierat, z krmív a zo súvisiaceho prostredia Európskemu úradu pre bezpečnosť potravín (ďalej len „úrad“), ktorý spolu s Európskym centrom pre prevenciu a kontrolu chorôb (ECDC) vyvinul spoločný systém „jedno zdravie“. V rámci spoločného systému „jedno zdravie“ môže daný orgán porovnať výsledky z WGS vykonaného na izolátoch uvedených patogénov zozbieraných v súlade s týmto nariadením s výsledkami z WGS vykonaného na ľudských izolátoch oznámenými ECDC v súlade s článkom 13 ods. 3 písm. d) nariadenia (EÚ) 2022/2371. Takéto porovnanie umožňuje identifikáciu zdroja ohniska a postihnutých zásielok, ak sa používajú v kombinácii s údajmi z epidemiologických šetrení. Pri zasielaní výsledkov WGS úradu EFSA by sa mali zahrnúť ďalšie súvisiace údaje, ktoré sú nevyhnutné na šetrenie ohnísk chorôb pochádzajúcich z potravín.

(6)

Je vhodné poskytnúť členským štátom a úradu dostatočný čas na prispôsobenie sa novým požiadavkám na zber izolátov získaných zo vzoriek potravín, zvierat, krmív a zo súvisiaceho prostredia, na WGS vykonané na týchto izolátoch a na prenos súvisiacich údajov s cieľom zabezpečiť potrebné technické aplikácie a finančné prostriedky. Požiadavky uvedené v tomto nariadení by sa preto mali začať uplatňovať 18 mesiacov odo dňa nadobudnutia účinnosti tohto nariadenia.

(7)

Opatrenia stanovené v tomto nariadení sú v súlade so stanoviskom Stáleho výboru pre rastliny, zvieratá, potraviny a krmivá,